More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0136 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  100 
 
 		 69 aa  147  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  70.15 
 
 		 66 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 65 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  62.69 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 70 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 72 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  62.32 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 71 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  58.57 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 76 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 73 aa  87  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  58.21 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 72 aa  84.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  62.9 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  84.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  56.72 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  50.75 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  52.94 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  54.29 
 
 		 74 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>