More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0322 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  100 
 
 		 67 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  78.79 
 
 		 75 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  75.38 
 
 		 68 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  78.79 
 
 		 72 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  75.76 
 
 		 74 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  77.27 
 
 		 68 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  75.76 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  69.23 
 
 		 75 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  69.23 
 
 		 75 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  68.66 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  71.21 
 
 		 67 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 68 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 68 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 74 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  99.4  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  60 
 
 		 70 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  61.54 
 
 		 70 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 70 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 65 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 71 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  69.23 
 
 		 71 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 74 aa  97.1  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 75 aa  96.7  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  60 
 
 		 73 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  65.67 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 74 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 71 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 73 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  57.81 
 
 		 77 aa  94.4  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 66 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  60 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 71 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 65 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  60.61 
 
 		 73 aa  93.6  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  65.67 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  61.54 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 72 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  59.72 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 80 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 71 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 72 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 72 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 72 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 71 aa  90.1  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 71 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  63.24 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 78 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>