More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0220 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  100 
 
 
82 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  100 
 
 
82 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  80.49 
 
 
83 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  71.79 
 
 
94 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  67.07 
 
 
86 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  68.29 
 
 
93 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  81.82 
 
 
79 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  70.73 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  69.51 
 
 
83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  70.51 
 
 
86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  65.85 
 
 
86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  70.51 
 
 
86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  80.88 
 
 
77 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  77.27 
 
 
86 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  80.3 
 
 
90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  77.27 
 
 
79 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  69.23 
 
 
77 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  71.21 
 
 
98 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  62.5 
 
 
74 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  61.29 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 
72 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9266  predicted protein  55.56 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0629418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  53.62 
 
 
70 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  45.83 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  43.24 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  43.24 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  51.56 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  42.47 
 
 
74 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  46.27 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  50.72 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  44.62 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  43.75 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  48.44 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  45.31 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  50 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  45.59 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  43.08 
 
 
68 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  43.75 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 
71 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  50.82 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  44.12 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  50 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  45.57 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  49.23 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  48.48 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  45.59 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  45.45 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  47.89 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  45.31 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  45.45 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  48.53 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  44.93 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  50 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  41.94 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  38.89 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  45 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  39.73 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  46.97 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  46.15 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  43.24 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  43.24 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  43.08 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  46.27 
 
 
71 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  50 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  43.75 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  42.19 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  45.07 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>