More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2668 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  100 
 
 		 105 aa  219  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  54 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  54 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  58.75 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  54 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 86 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  55 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  55 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  53.09 
 
 		 83 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  53.57 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  58.67 
 
 		 79 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  51.19 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  51.19 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  58.33 
 
 		 77 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  61.29 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  61.29 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  58.06 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  57.35 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  56.94 
 
 		 74 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  51.32 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0577  50S ribosomal protein L31  56.34 
 
 		 72 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  55.88 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  46.67 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  44 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 69 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 70 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  43.59 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  42.67 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  41.67 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  39.71 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  50 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_9266  predicted protein  47.46 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  43.75 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  42.03 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  42.25 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  49.21 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  48.44 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  44.78 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  44.29 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  42.86 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  36.11 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  41.27 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  41.27 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  40.28 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  41.43 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  46.88 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  38.57 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  34.48 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  46.03 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  41.43 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  40.62 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  37.14 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  37.31 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  37.31 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  39.68 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  42.11 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  42.19 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  39.68 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  47.62 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  37.31 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>