More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2792 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  100 
 
 		 69 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 74 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 70 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  62.32 
 
 		 69 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  59.42 
 
 		 71 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 71 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  64.06 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 65 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 79 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  46.38 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 72 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 73 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 72 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  50.77 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  49.28 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  46.15 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 73 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  46.15 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  53.62 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  54.69 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  53.85 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  47.69 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  44.62 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  54.1 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>