More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl638 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0140  50S ribosomal protein L31  70.65 
 
 		 92 aa  147  4e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  44.74 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  46.05 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 70 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  44.74 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  40.79 
 
 		 79 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  40.79 
 
 		 79 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17121  50S ribosomal protein L31  39.08 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23311  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17381  50S ribosomal protein L31  38.64 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1623  50S ribosomal protein L31  37.93 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  43.42 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  42.11 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  46.97 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  38.71 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  38.71 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17221  50S ribosomal protein L31  36.36 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2204  50S ribosomal protein L31  37.18 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16501  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3074  ribosomal protein L31  33.33 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000909466  unclonable  0.0000000191791 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  48.48 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  40.3 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  45.95 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  35.56 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2983  50S ribosomal protein L31  41.1 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.943737  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  40.58 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  41.79 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1321  50S ribosomal protein L31  35.56 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.742076  normal  0.494561 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  41.56 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  42.25 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2668  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000863804  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  42.42 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0720  50S ribosomal protein L31  37.65 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000232123  normal  0.569304 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  43.94 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3732  ribosomal protein L31  40 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2697  ribosomal protein L31  34.09 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000195547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  36.76 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  38.24 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  40 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  36.76 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  36.76 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  40.58 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  36.76 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  40.3 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  43.06 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf449  50S ribosomal protein L31  47.54 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  40.3 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  43.94 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  36.76 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  40 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  46.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  34.15 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  42.86 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2588  50S ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  44.44 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  39.13 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  38.03 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>