More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1108 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1108  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  239  9e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19831  30S ribosomal protein S13  97.52 
 
 		 121 aa  213  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1976  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 121 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.515253  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16571  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 121 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.725711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1630  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 121 aa  196  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23241  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17191  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17291  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  194  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17451  30S ribosomal protein S13  85.95 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0355  30S ribosomal protein S13  83.47 
 
 		 121 aa  191  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2211  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2581  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 126 aa  151  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  58.2 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1314  30S ribosomal protein S13  68 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0713  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000350202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  59.02 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  59.83 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  55.37 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1011  30S ribosomal protein S13  58.62 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000227796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2304  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 124 aa  143  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  54.55 
 
 		 121 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  56.03 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.17 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3725  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 124 aa  140  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 126 aa  140  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  53.72 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 122 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  58.97 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0395  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0403  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5048  ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 124 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  55.74 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>