More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2211 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2211  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  244  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  73.6 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0713  30S ribosomal protein S13  82.93 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000350202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 123 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2581  30S ribosomal protein S13  80.49 
 
 		 126 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  71.2 
 
 		 125 aa  176  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  69.6 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 124 aa  169  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2990  30S ribosomal protein S13  80.2 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.974488  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  67.2 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3725  30S ribosomal protein S13  77.24 
 
 		 127 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0227  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 127 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000782348  normal  0.0233895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0230  30S ribosomal protein S13  78.05 
 
 		 127 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  66.4 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  65.6 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 123 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  66.12 
 
 		 121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 127 aa  163  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  64 
 
 		 125 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  64 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  62.6 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 126 aa  160  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  64 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0355  30S ribosomal protein S13  73.77 
 
 		 121 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  68.64 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  156  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  61.79 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  156  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60.66 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1976  30S ribosomal protein S13  73.77 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.515253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  65.32 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17191  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  62.4 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1314  30S ribosomal protein S13  76.24 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23241  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17291  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1108  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 125 aa  154  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  62.3 
 
 		 122 aa  154  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16571  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.725711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17451  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>