34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67675 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_67675  predicted protein  100 
 
 		 980 aa  2026    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.364575  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00407  RNA polymerase III transcription factor TFIIIC subunit (Tfc4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04980)  28.35 
 
 		 1077 aa  302  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221403 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00810  RNA polymerase III transcription factor, putative  21.17 
 
 		 971 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  27.64 
 
 		 336 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  25.48 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 471 aa  53.9  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  21.86 
 
 		 272 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 1154 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 1069 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  23.24 
 
 		 636 aa  50.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 329 aa  50.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 878 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  19.3 
 
 		 623 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.19 
 
 		 875 aa  49.3  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 448 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 597 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37252  predicted protein  35.66 
 
 		 689 aa  48.1  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000000758174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.48 
 
 		 676 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.41 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 1056 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.63 
 
 		 825 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.53 
 
 		 887 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.65 
 
 		 681 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 436 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 4489 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.79 
 
 		 2240 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 562 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  25 
 
 		 784 aa  45.8  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.33 
 
 		 1764 aa  45.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 279 aa  45.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  28.74 
 
 		 1157 aa  44.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.84 
 
 		 576 aa  44.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  25.65 
 
 		 1157 aa  44.3  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>