138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29627 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29627  PF1 P-type ATPase  100 
 
 
454 aa  936    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60393  P-type ATPase  60.58 
 
 
1209 aa  480  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0027505  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10367  P-type ATPase Ion transporter (Eurofung)  41.29 
 
 
1221 aa  249  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04860  ATPase, putative  37.78 
 
 
1169 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0563137  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_516  P-ATPase family transporter: cation  30.84 
 
 
1094 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_199  P-ATPase family transporter: cation  30.84 
 
 
1094 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.058592  hitchhiker  0.00557165 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33744  SPF1 P-type ATPase  63.81 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146155  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54805  atpase2-p5  29.41 
 
 
1181 aa  106  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54285  P5, P type ATPase  32.14 
 
 
1138 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03190  membrane protein, putative  28.99 
 
 
1592 aa  90.1  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58093  cation translocating P-type ATPase  28.44 
 
 
1358 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.128504  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08864  P-type ATPase, putative (Eurofung)  27.5 
 
 
1299 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1051  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.02 
 
 
735 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
829 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3175  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  30.37 
 
 
835 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3086  plasma-membrane proton-efflux P-type ATPase, putative  29.63 
 
 
763 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2687  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  29.63 
 
 
763 aa  53.9  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.152646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2211  ATPase  27.78 
 
 
912 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000167608  normal  0.373323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3556  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  28.46 
 
 
836 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290899  normal  0.986505 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0834  cation transport ATPase  33.03 
 
 
634 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.176691  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2670  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  24.37 
 
 
899 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.057227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2777  H(+)-transporting ATPase  29.13 
 
 
739 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0966229  normal  0.0251077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0505  plasma-membrane proton-efflux P-type ATPase  40 
 
 
785 aa  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0587052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  27.18 
 
 
807 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2663  ATPase, E1-E2 type  24.68 
 
 
863 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  30.53 
 
 
853 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1399  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  26.42 
 
 
896 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.878809  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  25.51 
 
 
925 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2666  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25.99 
 
 
864 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0153597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0470  cation-transporting ATPase, E1-E2 family  28.65 
 
 
888 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  30.53 
 
 
853 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2778  H(+)-transporting ATPase  38.03 
 
 
810 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0754903  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 
839 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2565  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  24.69 
 
 
898 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.518632  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0519  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.84 
 
 
888 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0391  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.84 
 
 
888 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0379  cation-transporting ATPase A, P type (ATPase, E1-E2 type)  29.84 
 
 
888 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0405  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.84 
 
 
888 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  30.25 
 
 
748 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  30.48 
 
 
811 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0434  cation transport ATPase  27.43 
 
 
887 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3452  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25 
 
 
855 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.213738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
817 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0449  cation-transporting ATPase, E1-E2 family  29.84 
 
 
888 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01628  sodium ion P-type ATPase (Eurofung)  28.3 
 
 
1051 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0382  cation-transporting ATPase A, P type (ATPase, E1-E2 type)  29.84 
 
 
888 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2380  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  28.22 
 
 
882 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1648  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  27.39 
 
 
932 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0632  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25.3 
 
 
877 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0188  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  27.04 
 
 
939 aa  47.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3920  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  28.43 
 
 
907 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  25.83 
 
 
711 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  25.96 
 
 
827 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  26.42 
 
 
760 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0385  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  28.23 
 
 
888 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1311  Mg2+-importing ATPase, putative  29.63 
 
 
870 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0904573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
789 aa  47  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 
838 aa  46.6  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  28.47 
 
 
698 aa  46.6  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0514  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.61 
 
 
894 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3040  ATPase, E1-E2 type  30.49 
 
 
905 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1101  ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter  25.84 
 
 
909 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  28.75 
 
 
797 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2422  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  30.86 
 
 
912 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372219  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1118  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25.84 
 
 
909 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.048897  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1130  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25.84 
 
 
863 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71989  normal  0.453744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12029  metal cation transporter P-type ATPase A ctpF  28.15 
 
 
905 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4854  cation-transporting ATPase, E1-E2 family  29.03 
 
 
888 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468494  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30030  P-type ATPase, translocating  44.07 
 
 
926 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  30.39 
 
 
805 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0519  cation-transporting ATPase, E1-E2 family  29.03 
 
 
888 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2363  calcium-translocating P-type ATPase, PMCA-type  27.75 
 
 
885 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01260  plasma membrane H(+)-ATPase 1  27.72 
 
 
997 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1185  ATPase, E1-E2 type  36 
 
 
811 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3557  ATPase, E1-E2 type  27.08 
 
 
912 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  28.85 
 
 
805 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2800  ATPase, E1-E2 type  24.67 
 
 
856 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.682914  normal  0.508404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  24 
 
 
836 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  22.73 
 
 
818 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  28.85 
 
 
813 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0291  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  27.08 
 
 
812 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2753  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  26.4 
 
 
883 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.19157  normal  0.993386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4579  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  25.35 
 
 
906 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574239  decreased coverage  0.00038778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2036  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  28.46 
 
 
857 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
748 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1264  cation transporter E1-E2 family ATPase  25.4 
 
 
1512 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.956152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
801 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1309  cation-transporting P-ATPase PacL  28.12 
 
 
837 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0493  magnesium-translocating P-type ATPase  28.48 
 
 
828 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  25 
 
 
829 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44920  Cation transportingP-type ATPase  29.29 
 
 
912 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0985  hypothetical protein  24.51 
 
 
844 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.446349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  28.85 
 
 
805 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19890  P-type ATPase, translocating  23.35 
 
 
974 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0486105  decreased coverage  0.0039652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 
835 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1863  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  29.89 
 
 
893 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  27.88 
 
 
813 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3076  ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter  29.76 
 
 
917 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5863  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  24.9 
 
 
942 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  31.4 
 
 
739 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>