44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56522 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_56522  predicted protein  100 
 
 		 230 aa  478  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45252  predicted protein  43.62 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44374  predicted protein  43.55 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49634  predicted protein  27.42 
 
 		 621 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387641  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  32.88 
 
 		 117 aa  47  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  38.71 
 
 		 117 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.51 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  32.14 
 
 		 107 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  32.14 
 
 		 107 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.58 
 
 		 107 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  25.89 
 
 		 570 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  31.25 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  35.87 
 
 		 108 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  31.75 
 
 		 105 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  28.75 
 
 		 105 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  31.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  25.27 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 492 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  37.14 
 
 		 124 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  32.79 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  36.67 
 
 		 106 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  34.67 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  34.21 
 
 		 104 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  34.33 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  35.59 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.82 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  35.29 
 
 		 110 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  33.82 
 
 		 131 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  31.43 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  31.43 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  38.6 
 
 		 103 aa  42.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.55 
 
 		 406 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49158  predicted protein  35.62 
 
 		 462 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  27.78 
 
 		 153 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  35.59 
 
 		 109 aa  42  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  33.72 
 
 		 310 aa  42  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281124 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  28.18 
 
 		 513 aa  42.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  32.81 
 
 		 123 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  30.69 
 
 		 304 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  35.48 
 
 		 130 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51354  predicted protein  26.58 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.955254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.29 
 
 		 106 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>