104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50058 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50058  predicted protein  100 
 
 
1312 aa  2690    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  22.79 
 
 
4917 aa  65.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  25.75 
 
 
4979 aa  64.3  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.32 
 
 
308 aa  62.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  25.55 
 
 
4844 aa  59.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  26.42 
 
 
400 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  25.76 
 
 
301 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  27.33 
 
 
315 aa  56.2  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.63 
 
 
272 aa  55.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  31.3 
 
 
267 aa  55.5  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  32.23 
 
 
267 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  21.67 
 
 
1879 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  32.06 
 
 
267 aa  53.5  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  26.67 
 
 
409 aa  53.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 
286 aa  52.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  26.67 
 
 
346 aa  52.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  31.01 
 
 
285 aa  52.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  30.53 
 
 
267 aa  52.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.23 
 
 
267 aa  52.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  32.31 
 
 
268 aa  52.4  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.63 
 
 
278 aa  52.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.21 
 
 
286 aa  52  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  30.53 
 
 
267 aa  52  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  24.88 
 
 
313 aa  51.6  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.53 
 
 
267 aa  51.6  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.95 
 
 
297 aa  51.6  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  36.96 
 
 
265 aa  51.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  21.52 
 
 
263 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  21.52 
 
 
263 aa  51.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  29.79 
 
 
268 aa  51.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.3 
 
 
267 aa  51.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.23 
 
 
271 aa  50.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  30.3 
 
 
267 aa  51.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.4 
 
 
314 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  31.15 
 
 
282 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  32.14 
 
 
277 aa  50.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  26.95 
 
 
268 aa  50.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  30.28 
 
 
267 aa  50.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  30.28 
 
 
267 aa  50.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  31.09 
 
 
276 aa  50.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  29.55 
 
 
272 aa  49.7  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  30.53 
 
 
260 aa  50.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  31.19 
 
 
265 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.09 
 
 
271 aa  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  31.09 
 
 
260 aa  49.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  26.89 
 
 
271 aa  49.3  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  29.49 
 
 
270 aa  49.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.55 
 
 
263 aa  49.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  28.83 
 
 
272 aa  49.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  26.32 
 
 
307 aa  49.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  31.82 
 
 
273 aa  49.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.32 
 
 
307 aa  49.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.99 
 
 
301 aa  49.3  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  27.64 
 
 
270 aa  48.9  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  34.09 
 
 
267 aa  49.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  34.09 
 
 
267 aa  49.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  36.17 
 
 
273 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  31.3 
 
 
282 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  31.3 
 
 
282 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  34.09 
 
 
267 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  31.3 
 
 
282 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.87 
 
 
295 aa  48.5  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  31.06 
 
 
268 aa  48.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  25.79 
 
 
280 aa  48.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  34.09 
 
 
267 aa  48.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  30.63 
 
 
269 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.06 
 
 
272 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.79 
 
 
290 aa  47.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.06 
 
 
272 aa  48.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  33.01 
 
 
266 aa  47  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  22.86 
 
 
364 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  24.6 
 
 
338 aa  47  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  31.93 
 
 
270 aa  47.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  29.91 
 
 
272 aa  47.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  22.86 
 
 
364 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  34.09 
 
 
266 aa  47.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  27.86 
 
 
265 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  36.71 
 
 
285 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.63 
 
 
266 aa  47.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  24.62 
 
 
306 aa  47.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  29.23 
 
 
307 aa  47  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  34.09 
 
 
260 aa  46.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  34.09 
 
 
260 aa  46.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  29.46 
 
 
275 aa  46.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  29.41 
 
 
284 aa  46.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  32 
 
 
269 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  28.67 
 
 
278 aa  46.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  46.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  30 
 
 
271 aa  46.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  27.89 
 
 
272 aa  46.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  26.76 
 
 
260 aa  46.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  27.66 
 
 
265 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  25.28 
 
 
338 aa  45.8  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  27.66 
 
 
265 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  27.93 
 
 
272 aa  46.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  35.8 
 
 
266 aa  45.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  25 
 
 
620 aa  45.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  30.33 
 
 
283 aa  45.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  30.33 
 
 
283 aa  45.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>