More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0037 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  99.26 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  90.07 
 
 		 272 aa  500  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  86.4 
 
 		 272 aa  481  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  85.24 
 
 		 272 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.68 
 
 		 272 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1102  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.97 
 
 		 281 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000686062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3634  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.97 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  26.32 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.5 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  33.63 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  28.71 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.97 
 
 		 334 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.64 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  27.41 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.52 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  25.36 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  28.76 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.05 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  26.6 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.62 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  27.87 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.5 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  25.63 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  26.57 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  29.33 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  35.59 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  32.24 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.07 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  28.86 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.78 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  29.52 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.05 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.942326 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  31.25 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  33.9 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  30.2 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  31.65 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  30.13 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.62 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  30.27 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  27.5 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  29.12 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.37 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  29.87 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.27 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  28.74 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  25 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  26.23 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  28.15 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.88 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  26.64 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.01 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  24.88 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  29.49 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  31.79 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  29.14 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  26.03 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  29.95 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  27.32 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  30.32 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  28.5 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  32.45 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  27.51 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.44 
 
 		 341 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.21 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  24.79 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  28.48 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  29.68 
 
 		 328 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.62 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  29.41 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.54 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  30 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3573  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.57 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  26 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  31.37 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.44 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  31.68 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  25 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  25 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.97 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.5 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.68 
 
 		 349 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.52 
 
 		 356 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.93 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  27.18 
 
 		 305 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  33.9 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  30.26 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  25 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  30.2 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.4 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  25.49 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  28.65 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.56 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  24.81 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.79 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.16 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  30.26 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  30.41 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>