51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39534 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39534  predicted protein  100 
 
 		 572 aa  1195    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48934  predicted protein  37.68 
 
 		 427 aa  277  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50511  predicted protein  37.65 
 
 		 487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36581  predicted protein  30.2 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43405  predicted protein  32.65 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  36.84 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04190  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 538 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  30.77 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  30.56 
 
 		 300 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54087  predicted protein  27.13 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.027692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  31.58 
 
 		 300 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  30.25 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  26.32 
 
 		 327 aa  51.6  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  30.38 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  31.58 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  31.03 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  31.03 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  25.56 
 
 		 277 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  31.33 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  31.03 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  33.77 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  29.25 
 
 		 310 aa  47.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  32.05 
 
 		 303 aa  47.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  29.27 
 
 		 298 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 309 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  31.43 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  30.12 
 
 		 299 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27908  predicted protein  23.08 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.789024  normal  0.584892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  30.26 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  28.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  30.26 
 
 		 305 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  28.95 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  28.95 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.99 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  28.99 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  26.25 
 
 		 321 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  28.99 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45771  predicted protein  23.47 
 
 		 947 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  28.38 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  27.63 
 
 		 321 aa  43.9  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  31.43 
 
 		 308 aa  43.5  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>