58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48934 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_48934  predicted protein  100 
 
 
427 aa  892    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39534  predicted protein  38.21 
 
 
572 aa  276  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50511  predicted protein  34.78 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36581  predicted protein  45 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  23.42 
 
 
303 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  26.63 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  29.41 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  18.21 
 
 
300 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  27.27 
 
 
277 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  18.89 
 
 
327 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  20 
 
 
290 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_006686  CND04190  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 
538 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  27.45 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  22.48 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43405  predicted protein  26.85 
 
 
613 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  22.48 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  22.33 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  22.33 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  22.48 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  22.33 
 
 
304 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  26.42 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  23.81 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  22.78 
 
 
302 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  27.63 
 
 
286 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  29.79 
 
 
287 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  20.31 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  20.31 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  20.31 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  22.01 
 
 
304 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  22.01 
 
 
304 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  22.15 
 
 
321 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  21.38 
 
 
310 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  22.15 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  22.15 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  22.15 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  22.15 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  19.18 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  22.15 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  22.15 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  30.49 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  20.38 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  18.87 
 
 
306 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  21.64 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  26.55 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  23.39 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45771  predicted protein  25.69 
 
 
947 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  20.25 
 
 
321 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  30.26 
 
 
299 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  29.13 
 
 
303 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  21.12 
 
 
305 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  30.26 
 
 
299 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  21.41 
 
 
306 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  30.26 
 
 
299 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  17.16 
 
 
293 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  30.59 
 
 
306 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  22.83 
 
 
318 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  30.26 
 
 
309 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  20.95 
 
 
299 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>