15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43405 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43405  predicted protein  100 
 
 
613 aa  1283    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297103  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54087  predicted protein  45.42 
 
 
549 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.027692  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45771  predicted protein  42.73 
 
 
947 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39534  predicted protein  32.65 
 
 
572 aa  60.8  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  32.32 
 
 
302 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50511  predicted protein  30.23 
 
 
487 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48934  predicted protein  26.85 
 
 
427 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  23.74 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  30.91 
 
 
302 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>