More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23083 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_23083  predicted protein  100 
 
 		 426 aa  879    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  70.99 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  70.99 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  71.17 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  71.17 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.48 
 
 		 396 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.41 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  70.41 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  69.21 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  69.64 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  70.51 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  70.51 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12576  Translation elongation factor, mitochondrial  72.68 
 
 		 401 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.23 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  68.21 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  68.21 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  68.96 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  68.62 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  68.21 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  68.46 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  69.57 
 
 		 395 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  68.96 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  68.88 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  70.08 
 
 		 391 aa  574  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  66.92 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  66.92 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  68.62 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  67.95 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  67.95 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  70.08 
 
 		 391 aa  574  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  67.35 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  67.35 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  68.45 
 
 		 395 aa  568  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  67.95 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0581  elongation factor Tu  67.69 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4917  elongation factor Tu  67.69 
 
 		 397 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  67.43 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  68.54 
 
 		 396 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 397 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  68.37 
 
 		 396 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  67.68 
 
 		 397 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 397 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 391 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  67.35 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  67.44 
 
 		 396 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 397 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 397 aa  571  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  67.95 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  68.54 
 
 		 396 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  68.11 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>