More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19949 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_19949  predicted protein  100 
 
 
393 aa  809    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  43.01 
 
 
510 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  42.49 
 
 
513 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  42.38 
 
 
507 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  41.41 
 
 
525 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  42.82 
 
 
507 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  39.9 
 
 
507 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  40 
 
 
516 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  38.99 
 
 
505 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  40.62 
 
 
515 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  39.36 
 
 
508 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  38.34 
 
 
510 aa  242  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.4 
 
 
520 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.07 
 
 
515 aa  242  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  37.14 
 
 
504 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  38.82 
 
 
509 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  37.12 
 
 
720 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.69 
 
 
705 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  34.98 
 
 
532 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  36.68 
 
 
713 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  39.2 
 
 
472 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.37 
 
 
482 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  34.53 
 
 
716 aa  205  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.23 
 
 
473 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.62 
 
 
712 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.7 
 
 
472 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.71 
 
 
704 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.36 
 
 
471 aa  199  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.47 
 
 
475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.67 
 
 
717 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.58 
 
 
480 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.2 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.97 
 
 
484 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
722 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  33.58 
 
 
716 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.83 
 
 
722 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.54 
 
 
495 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  33.67 
 
 
738 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  32.48 
 
 
717 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 
722 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.46 
 
 
713 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.71 
 
 
472 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.29 
 
 
474 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.18 
 
 
746 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.85 
 
 
475 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.82 
 
 
473 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.58 
 
 
717 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.07 
 
 
494 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.83 
 
 
714 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  34.65 
 
 
546 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.67 
 
 
488 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  33.81 
 
 
557 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.3 
 
 
714 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.71 
 
 
482 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.12 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.52 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  33.42 
 
 
470 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.42 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.09 
 
 
508 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  31.62 
 
 
546 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  33.96 
 
 
470 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  33.15 
 
 
561 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  31.62 
 
 
546 aa  169  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.42 
 
 
470 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  32.88 
 
 
561 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.83 
 
 
465 aa  168  1e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  32.88 
 
 
561 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  32.88 
 
 
561 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  33.33 
 
 
477 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  32.88 
 
 
561 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  32.88 
 
 
561 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  34.09 
 
 
453 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  31.96 
 
 
467 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  31.96 
 
 
503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  33.24 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  32.72 
 
 
561 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  31.36 
 
 
548 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  32.21 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.37 
 
 
473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  33.7 
 
 
486 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.06 
 
 
562 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  32.51 
 
 
468 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.04 
 
 
466 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  32.38 
 
 
550 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.42 
 
 
470 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2588  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
452 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.896583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.25 
 
 
767 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  33.05 
 
 
561 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  28.61 
 
 
489 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  31.28 
 
 
468 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  32.38 
 
 
561 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1896  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.27 
 
 
452 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.447671  decreased coverage  0.00000000000000861122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  32.26 
 
 
552 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 
468 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 
468 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  31.64 
 
 
460 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  31.4 
 
 
468 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  30.19 
 
 
458 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.77 
 
 
460 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>