More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5621 on replicon NC_011734
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011734  PCC7424_5621  Ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
171 aa  333  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5603  hypothetical protein  85.54 
 
 
86 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  56.76 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  58.82 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  54.41 
 
 
128 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  53.62 
 
 
131 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0590  50S ribosomal protein L7/L12  45.21 
 
 
130 aa  63.2  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000889799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
125 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3732  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
122 aa  62  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  62  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  47.14 
 
 
121 aa  62  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  48.53 
 
 
129 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
121 aa  61.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
121 aa  60.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2867  50S ribosomal protein L7/L12  48.53 
 
 
121 aa  60.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  47.3 
 
 
124 aa  60.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  47.3 
 
 
121 aa  60.8  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  45.95 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  47.3 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  56.9 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  47.3 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  51.35 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  54.39 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  48.53 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
123 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  56.9 
 
 
125 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  45.95 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  49.33 
 
 
131 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  45.59 
 
 
128 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  44.59 
 
 
124 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  48.57 
 
 
124 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
123 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  48.53 
 
 
121 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  48.53 
 
 
129 aa  58.2  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.17 
 
 
123 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  48.53 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  48.57 
 
 
124 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0848  50S ribosomal protein L7/L12  47.95 
 
 
124 aa  57.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  44.12 
 
 
125 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  34.86 
 
 
121 aa  57.4  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  57.4  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  44.12 
 
 
128 aa  57.8  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  48.53 
 
 
132 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  47.06 
 
 
122 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  45.95 
 
 
129 aa  57.4  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  45.95 
 
 
128 aa  57.4  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
129 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  44.59 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  45.95 
 
 
131 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  53.45 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  35 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  44.3 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  45.71 
 
 
126 aa  57.4  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  44.59 
 
 
131 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  50.72 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  44.59 
 
 
131 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
126 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  44.59 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2073  ribosomal protein L7/L12  48.53 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  44.59 
 
 
131 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  48.53 
 
 
125 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  48.65 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  47.06 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  47.3 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  49.28 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  31.71 
 
 
121 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  53.45 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>