50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  94.86 
 
 		 406 aa  590  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  76.97 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  69.84 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  70.07 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  65.23 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  65.56 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  67.43 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  67.43 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  66.45 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  64.82 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  44.48 
 
 		 473 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  43.17 
 
 		 432 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  40.6 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  44.55 
 
 		 471 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  42.38 
 
 		 466 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  48.18 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  42.04 
 
 		 471 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  40.79 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  41.64 
 
 		 467 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  42.57 
 
 		 426 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  40.88 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  41.42 
 
 		 438 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  39.73 
 
 		 398 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  39.67 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  41.64 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  44.55 
 
 		 456 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  43.19 
 
 		 428 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  44.87 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  44.55 
 
 		 455 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.11 
 
 		 397 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  44.37 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  40.2 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  41.1 
 
 		 468 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  45.48 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  42.48 
 
 		 438 aa  198  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  37.54 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  27.01 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  27.14 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  24.62 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  26.76 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  28.48 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  28.48 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  28.48 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  28.48 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>