40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4273 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  824    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  66.5 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  62.69 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  62.94 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  69.04 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  66.01 
 
 		 406 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  64.91 
 
 		 401 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  63.66 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  64.16 
 
 		 401 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  61.63 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  70.07 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  37.91 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  37.94 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  38.8 
 
 		 473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  37.74 
 
 		 426 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  40.72 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  37.91 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  35.85 
 
 		 471 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  36.04 
 
 		 466 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  38.46 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  36.14 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  35.31 
 
 		 467 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  37.15 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  35.33 
 
 		 477 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  34.26 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  37.92 
 
 		 455 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  37.36 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  37.56 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  42.58 
 
 		 471 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  42.35 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  38.44 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  32.61 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  39.53 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  41.46 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  35.82 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.2 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  32.17 
 
 		 283 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  31.47 
 
 		 280 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>