37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1837 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  768    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  47.69 
 
 
390 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.72 
 
 
397 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  43.5 
 
 
414 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  42.96 
 
 
401 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  42.82 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  42.5 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  41.12 
 
 
401 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  36.98 
 
 
473 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  40.25 
 
 
423 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  42.04 
 
 
401 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  37.5 
 
 
420 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  34.27 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  35.25 
 
 
398 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  34.06 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  42.75 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  37.29 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  41.46 
 
 
412 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  34.16 
 
 
398 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  37.28 
 
 
406 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  34.47 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  34.92 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  34.47 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  33.56 
 
 
456 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  42.03 
 
 
411 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  33.26 
 
 
466 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  33.12 
 
 
471 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  32.75 
 
 
467 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  36.71 
 
 
426 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  32.48 
 
 
477 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  33.66 
 
 
426 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  31.21 
 
 
438 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  45.48 
 
 
311 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  32.32 
 
 
396 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  37.1 
 
 
468 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  37.44 
 
 
438 aa  190  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>