43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5894 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  796    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  94.86 
 
 		 311 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  72.11 
 
 		 411 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  66.01 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  66.33 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  61.65 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  61.42 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  63.34 
 
 		 401 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  63.09 
 
 		 401 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  61.85 
 
 		 401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  62 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  37.78 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  38.33 
 
 		 473 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  36.87 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  36.23 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  44.17 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  37.91 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  36.11 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  38.21 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  36.54 
 
 		 471 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  36.56 
 
 		 466 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  36.93 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  36.38 
 
 		 467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  36.67 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  35.27 
 
 		 477 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  38.72 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  35.51 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  41.35 
 
 		 438 aa  226  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  40.84 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  37.47 
 
 		 455 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  43.25 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.5 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  36.67 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  41.21 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  40.2 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  42.81 
 
 		 438 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  30.88 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  25.71 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  28.95 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  24.6 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  28.35 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>