39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1688 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  820    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  46.97 
 
 		 398 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  47.21 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  43.83 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  40.48 
 
 		 428 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  39.81 
 
 		 426 aa  292  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  37.38 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  38.94 
 
 		 420 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  39.61 
 
 		 473 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  37.69 
 
 		 466 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  37 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  38.24 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  37.39 
 
 		 467 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  37.12 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  39.44 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  37.95 
 
 		 455 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  37.95 
 
 		 455 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  38.13 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  45.31 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  36.62 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  36.5 
 
 		 477 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.53 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  36.91 
 
 		 438 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  34.85 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  35.92 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  34.6 
 
 		 423 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  36.87 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  37.08 
 
 		 411 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  36.18 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  36.04 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  34.26 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  34.77 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  33.76 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  34.01 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  40.79 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  33.68 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  32.32 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  28.95 
 
 		 277 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  28.03 
 
 		 404 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>