37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1181 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  885    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  51 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  47.64 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  45.83 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  51.2 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  47.86 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  45.74 
 
 		 467 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  45.56 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  49.74 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  47.91 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  45.84 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  45.11 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  47.21 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  47.31 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  44.42 
 
 		 477 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 468 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  39.34 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  39.26 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  36.91 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  36.86 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  41.04 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  39.8 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  38.02 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  35.78 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.53 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  35.39 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  42.81 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  35.89 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  37.07 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  35.8 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  39.33 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  35.76 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  42.48 
 
 		 311 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  38.49 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  38.68 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  37.44 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  38.48 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>