45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3160 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  64.71 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  54.32 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  56.47 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  54.63 
 
 		 466 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  58.07 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  54.51 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  53.55 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  53.81 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  55.95 
 
 		 428 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  56.15 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  55.92 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  56.91 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  52.8 
 
 		 438 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  48.22 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  49.14 
 
 		 438 aa  362  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  42.16 
 
 		 426 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  40.55 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  39.31 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  41.1 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  38.46 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  37.87 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  36.95 
 
 		 423 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  36.39 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  37.05 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  36.66 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.91 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  36.8 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  36.76 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  35.57 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  36.76 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  35.25 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  35.25 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  35.29 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  35.89 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  40.2 
 
 		 311 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  28.83 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  29.08 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  29.08 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  29.08 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  25.9 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  29.08 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  29.08 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  27.22 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>