37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1549 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  96.82 
 
 
471 aa  894    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  94.34 
 
 
477 aa  876    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  94.06 
 
 
467 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  943    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  70.48 
 
 
432 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  66.32 
 
 
471 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  66.6 
 
 
455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  65.96 
 
 
455 aa  568  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  67.68 
 
 
456 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  58.63 
 
 
473 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  55.11 
 
 
426 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  53.66 
 
 
438 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  54.03 
 
 
428 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  55.4 
 
 
406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  52.53 
 
 
468 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  45.84 
 
 
438 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  38.46 
 
 
420 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  37.69 
 
 
396 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  38.82 
 
 
426 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  36.96 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  36.76 
 
 
398 aa  266  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  35.62 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  35.91 
 
 
423 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  36.04 
 
 
412 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  38.38 
 
 
401 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  44.58 
 
 
401 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  36.12 
 
 
406 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  35.15 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  35.11 
 
 
423 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  35.03 
 
 
401 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  37.74 
 
 
401 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  42.86 
 
 
401 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  34.36 
 
 
414 aa  226  9e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  32.81 
 
 
397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  42.38 
 
 
311 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  33.7 
 
 
398 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  31.87 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>