42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2616 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1741  hypothetical protein  80.88 
 
 		 471 aa  717    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2716  hypothetical protein  91.09 
 
 		 456 aa  772    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2616  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  917    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2549  hypothetical protein  97.36 
 
 		 455 aa  845    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1545  hypothetical protein  66.95 
 
 		 467 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.349971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2801  hypothetical protein  65.89 
 
 		 471 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.70904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1549  hypothetical protein  66.67 
 
 		 466 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1579  hypothetical protein  65.7 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1444  hypothetical protein  68.12 
 
 		 432 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2737  hypothetical protein  57.37 
 
 		 473 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1364  hypothetical protein  55.06 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1509  hypothetical protein  55.96 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1712  hypothetical protein  57.87 
 
 		 428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3160  hypothetical protein  55.69 
 
 		 406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.927544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  51.09 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1181  hypothetical protein  47.91 
 
 		 438 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3487  hypothetical protein  38.68 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1688  hypothetical protein  37.95 
 
 		 396 aa  282  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.243841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01794  hypothetical protein  37.75 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003882  hypothetical protein  37.98 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1496  hypothetical protein  37.39 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3551  hypothetical protein  38.71 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5361  hypothetical protein  36.34 
 
 		 423 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0308  hypothetical protein  37.3 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000534116  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4915  hypothetical protein  36.28 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04300  hypothetical protein  37.21 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4273  hypothetical protein  37.81 
 
 		 412 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861564  hitchhiker  0.000000000308007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0297  hypothetical protein  38.15 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000071449  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0279  hypothetical protein  37.73 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00141559  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  42.32 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5894  hypothetical protein  36.79 
 
 		 406 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0302  hypothetical protein  37.5 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000220682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  45.02 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  32.49 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1837  hypothetical protein  34.69 
 
 		 398 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4931  hypothetical protein  35.68 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000903966  hitchhiker  0.000000101808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1225  hypothetical protein  38.71 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000882702  normal  0.259396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  25.84 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  25.84 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  25.84 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  25.84 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  25.28 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>