34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  76.76 
 
 		 659 aa  209  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  53.52 
 
 		 650 aa  140  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  53.06 
 
 		 668 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  52.05 
 
 		 617 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  52.05 
 
 		 616 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  51.06 
 
 		 616 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  50.36 
 
 		 619 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  49.32 
 
 		 639 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  45.52 
 
 		 671 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  48.2 
 
 		 648 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  41.38 
 
 		 670 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  39.39 
 
 		 632 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  35.07 
 
 		 655 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  32.64 
 
 		 661 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  33.09 
 
 		 622 aa  76.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  33.09 
 
 		 628 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  28.47 
 
 		 648 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  32.85 
 
 		 623 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  32.58 
 
 		 628 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  30.28 
 
 		 649 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  31.82 
 
 		 628 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  32.11 
 
 		 714 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  26.76 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  30.26 
 
 		 777 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  30.41 
 
 		 678 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  30.65 
 
 		 233 aa  51.2  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  29.55 
 
 		 633 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  28.46 
 
 		 616 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  28.46 
 
 		 616 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  30.72 
 
 		 773 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  25.31 
 
 		 708 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3133  hypothetical protein  34.69 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>