42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03640 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03640  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  42.06 
 
 		 617 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  41.63 
 
 		 616 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  42.92 
 
 		 619 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  41.63 
 
 		 616 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  41.91 
 
 		 659 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4354  hypothetical protein  41.53 
 
 		 648 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2651  hypothetical protein  40.42 
 
 		 650 aa  171  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20150  hypothetical protein  38.84 
 
 		 668 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4633  hypothetical protein  41.03 
 
 		 639 aa  167  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753582  normal  0.334854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0867  hypothetical protein  43.72 
 
 		 670 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1001  hypothetical protein  41.46 
 
 		 671 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0577161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2858  hypothetical protein  36.07 
 
 		 655 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231255  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2200  hypothetical protein  35.15 
 
 		 632 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805392  normal  0.382024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02514  hypothetical protein  34.84 
 
 		 648 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  33.76 
 
 		 622 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003553  hypothetical protein  34.87 
 
 		 646 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3710  hypothetical protein  34.88 
 
 		 633 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4176  hypothetical protein  35.57 
 
 		 577 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3879  hypothetical protein  37.79 
 
 		 616 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 623 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0461  hypothetical protein  37.33 
 
 		 616 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0435  hypothetical protein  38.89 
 
 		 628 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3532  hypothetical protein  32.86 
 
 		 615 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0451  hypothetical protein  37.33 
 
 		 628 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3347  hypothetical protein  34.35 
 
 		 626 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0286195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0423  hypothetical protein  34.15 
 
 		 615 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0550  hypothetical protein  34.2 
 
 		 628 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4072  hypothetical protein  33.17 
 
 		 661 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0600  hypothetical protein  44.62 
 
 		 708 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0574  hypothetical protein  32.07 
 
 		 649 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3931  hypothetical protein  40.4 
 
 		 714 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38010  hypothetical protein  55.41 
 
 		 477 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000364785  hitchhiker  0.00689119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  30.23 
 
 		 773 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1884  hypothetical protein  29.3 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.397644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5029  hypothetical protein  33.61 
 
 		 678 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3135  hypothetical protein  34.91 
 
 		 706 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2911  hypothetical protein  26.34 
 
 		 621 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000948701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  30.65 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  47.27 
 
 		 777 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1967  hypothetical protein  36.23 
 
 		 566 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2328  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  34.57 
 
 		 520 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>