10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3133 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3133  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0959  hypothetical protein  40.82 
 
 		 777 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2457  hypothetical protein  36.7 
 
 		 773 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2167  hypothetical protein  28.43 
 
 		 616 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3575  hypothetical protein  29.41 
 
 		 617 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0867  hypothetical protein  29.7 
 
 		 622 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.494606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38000  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000738389  normal  0.0264076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1684  hypothetical protein  31.96 
 
 		 619 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3238  hypothetical protein  30.93 
 
 		 659 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1708  hypothetical protein  28.16 
 
 		 616 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.948572  hitchhiker  0.0000786229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>