More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  89.91 
 
 		 480 aa  840    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  75.68 
 
 		 483 aa  727    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2989  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  97.71 
 
 		 481 aa  906    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  89.91 
 
 		 480 aa  839    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  76.21 
 
 		 483 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  86.9 
 
 		 481 aa  837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  90.99 
 
 		 480 aa  845    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35460  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  100 
 
 		 481 aa  961    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.0108121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  89.22 
 
 		 480 aa  844    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  63.08 
 
 		 480 aa  621  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  55.72 
 
 		 475 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  46.11 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  47.19 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  46.62 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2699  amino acid carrier protein  46.57 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  47.78 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  46.88 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  46.77 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  44.4 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  47.17 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  46.96 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  44.47 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  44.47 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  44.47 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  44.47 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  44.03 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  44.47 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  44.26 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  44.47 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  44.49 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  44.47 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  43.98 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  48.05 
 
 		 502 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  43.51 
 
 		 495 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  43.74 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  43.76 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  47.55 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  43.62 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  43.25 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  43.13 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  42.49 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  43.34 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  42.49 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  43.34 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  43.53 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  43.53 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  42.8 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  42.8 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  43.54 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  43.54 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  44.64 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  42.49 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  42.92 
 
 		 481 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  45.81 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  44 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  41.95 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  42.28 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  42.49 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.37 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  42.67 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  42.16 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  44.01 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  43.58 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  43.95 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  42.07 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  42.28 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  42.28 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  42.07 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  41.74 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  43.07 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  41.86 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3608  amino acid carrier protein  45.02 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221851  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  45.49 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  43.47 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  45.09 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  44.54 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  45.57 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  44.35 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  44.35 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  45.57 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  47.01 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  43.25 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  45.73 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  42 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2881  sodium/alanine symporter family protein  42.83 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  42.49 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  42.61 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  41.79 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  45.51 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  43.02 
 
 		 479 aa  363  2e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>