More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3608 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3608  amino acid carrier protein  100 
 
 		 475 aa  942    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221851  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2699  amino acid carrier protein  71.76 
 
 		 474 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  51.07 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  52.49 
 
 		 480 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  46.22 
 
 		 483 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  45.57 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  46.14 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  44.73 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 480 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  45.67 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  44.68 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  45.23 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  44.26 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  43.84 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  43.96 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  43.96 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  43.96 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  43.63 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  43.96 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  44.96 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  43.9 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  43.9 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  44.61 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  43.51 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35460  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  45.02 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.0108121 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  44.61 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2989  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  44.78 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  43.57 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  43.72 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  46.11 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  46.11 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  40.63 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.23 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  44.07 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  45.82 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  43.82 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  41.26 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  41.26 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  45.13 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  45.45 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  40.84 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  40.84 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  40.84 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  44.21 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  45.45 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  45.76 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  44.19 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  40.63 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  40.63 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  40.76 
 
 		 476 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  44.83 
 
 		 543 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  44.64 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  44.04 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  44.04 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  44.04 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  44.04 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  44.04 
 
 		 503 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  43.04 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  43.83 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  42.92 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  44.04 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  43.24 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  44.04 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  43.12 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  42.83 
 
 		 496 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  44.38 
 
 		 488 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  41.87 
 
 		 484 aa  352  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  43.7 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  42.89 
 
 		 502 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  43.04 
 
 		 497 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 477 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  43.04 
 
 		 497 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  43.04 
 
 		 497 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  39.96 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  40.17 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  44.28 
 
 		 468 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  39.32 
 
 		 477 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  39.32 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  45.09 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  39.75 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  43.31 
 
 		 474 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 		 474 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  45.56 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  39.45 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  44.38 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  44.38 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  43.49 
 
 		 477 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  43.39 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>