More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3598 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3598  bacitracin resistance protein BacA  100 
 
 
339 aa  662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1890  Undecaprenyl-diphosphatase  39.32 
 
 
278 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  39.73 
 
 
274 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.8 
 
 
270 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  35.74 
 
 
258 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  35.62 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.99 
 
 
277 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.69 
 
 
276 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.69 
 
 
276 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.69 
 
 
276 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.95 
 
 
277 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.05 
 
 
266 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.01 
 
 
276 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.99 
 
 
274 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.43 
 
 
274 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  37.88 
 
 
273 aa  149  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.67 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.46 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.42 
 
 
274 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.25 
 
 
277 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  38.44 
 
 
267 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.56 
 
 
268 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.97 
 
 
278 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.29 
 
 
276 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.43 
 
 
275 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.43 
 
 
280 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
274 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.91 
 
 
276 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  32.45 
 
 
281 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
274 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.42 
 
 
276 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.95 
 
 
276 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  35.03 
 
 
266 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  36.3 
 
 
276 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.05 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.09 
 
 
276 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.68 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  37.29 
 
 
276 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.75 
 
 
276 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.09 
 
 
276 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.4 
 
 
267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.86 
 
 
268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.09 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.18 
 
 
293 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.69 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.78 
 
 
283 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.03 
 
 
268 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  35.37 
 
 
285 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.75 
 
 
278 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0848  undecaprenol kinase  34.33 
 
 
307 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.433403  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.54 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.29 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.41 
 
 
274 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.76 
 
 
276 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.67 
 
 
277 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.1 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.69 
 
 
304 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.39 
 
 
276 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
273 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.77 
 
 
268 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.5 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.56 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.12 
 
 
268 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.67 
 
 
265 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  33.22 
 
 
263 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  34.31 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.89 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.64 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.64 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.37 
 
 
265 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.64 
 
 
270 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.89 
 
 
293 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.8 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  34.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  34.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.94 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  32.21 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.31 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.13 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  33.55 
 
 
266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.55 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  35.79 
 
 
274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.13 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  33.68 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  32.75 
 
 
252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.68 
 
 
265 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.32 
 
 
268 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1073  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.69 
 
 
273 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>