More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2827 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
276 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  99.28 
 
 
277 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  96.01 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  93.12 
 
 
276 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  83.27 
 
 
276 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  84.31 
 
 
277 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  82.55 
 
 
276 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  82.48 
 
 
277 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  81.52 
 
 
276 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  83.58 
 
 
277 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.06 
 
 
277 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  72.36 
 
 
276 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.09 
 
 
274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.82 
 
 
273 aa  317  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  58.76 
 
 
276 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.15 
 
 
274 aa  311  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  56.93 
 
 
274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.4 
 
 
293 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.88 
 
 
274 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.05 
 
 
293 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.37 
 
 
293 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  52.63 
 
 
285 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  53.38 
 
 
273 aa  292  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.86 
 
 
293 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.21 
 
 
274 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.83 
 
 
293 aa  284  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.51 
 
 
278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.26 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.54 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.81 
 
 
277 aa  281  9e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.11 
 
 
275 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.48 
 
 
274 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.81 
 
 
276 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.85 
 
 
274 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.17 
 
 
276 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.17 
 
 
276 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.17 
 
 
276 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.57 
 
 
274 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.13 
 
 
270 aa  275  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.51 
 
 
278 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.45 
 
 
276 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.72 
 
 
276 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.79 
 
 
303 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  51.55 
 
 
266 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.9 
 
 
278 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.3 
 
 
281 aa  261  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.68 
 
 
267 aa  260  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  47.96 
 
 
269 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.09 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.18 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  49.22 
 
 
267 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
267 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.57 
 
 
272 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.39 
 
 
280 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
283 aa  225  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.24 
 
 
268 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  45.49 
 
 
268 aa  221  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.8 
 
 
270 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  45.42 
 
 
267 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  42.86 
 
 
266 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.4 
 
 
268 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.9 
 
 
265 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.47 
 
 
273 aa  218  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  44.62 
 
 
267 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.85 
 
 
273 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.29 
 
 
274 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
265 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
265 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0283  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
265 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.53 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 
268 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  43.58 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0313  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.74 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>