More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0949 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  64.75 
 
 		 258 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  59.92 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  61.22 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  53.36 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  53.87 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  51.13 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3546  undecaprenol kinase  54.89 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  47.27 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  47.39 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  47.39 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  47.2 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  45.56 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  47.27 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  45.42 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  44.15 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  44.15 
 
 		 268 aa  204  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  49.41 
 
 		 252 aa  202  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.51 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.05 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.06 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  43.65 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 277 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 268 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.83 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  41.73 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  45.31 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  43.08 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  42.58 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.29 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  41.34 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  40 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  41.41 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.06 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  42.16 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.65 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.48 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  40.77 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.06 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.17 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  41.47 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.76 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.3 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1296  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00356905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1403  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  44.75 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  39.11 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.15 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  38.75 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  40.46 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.41 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0283  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.55 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.41 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  42.35 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  41.67 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  42.37 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.63 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0313  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.31 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.31 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.31 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 		 274 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39 
 
 		 274 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  43.97 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  42.74 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.46 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  38.75 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.95 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  40.93 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  40.93 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1110  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.47 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3908  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1436  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.02 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.648301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  37.74 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.46 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>