More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0666 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  65.92 
 
 		 274 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  64.86 
 
 		 273 aa  341  5.999999999999999e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.95 
 
 		 293 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  62.31 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.84 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.1 
 
 		 293 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.75 
 
 		 293 aa  324  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.49 
 
 		 293 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.31 
 
 		 274 aa  308  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.3 
 
 		 276 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  55.3 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.3 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.7 
 
 		 278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.58 
 
 		 275 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.25 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.78 
 
 		 277 aa  301  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.53 
 
 		 274 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.53 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.12 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  56.51 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.84 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.09 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.51 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.06 
 
 		 276 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.93 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.89 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.76 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.99 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  56.32 
 
 		 266 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.82 
 
 		 278 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.38 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.14 
 
 		 277 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.57 
 
 		 276 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.57 
 
 		 276 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.57 
 
 		 276 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.57 
 
 		 276 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.78 
 
 		 278 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.76 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.01 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.81 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.93 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.36 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.52 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  53.26 
 
 		 269 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  54.87 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.2 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.2 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.47 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.75 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  51.35 
 
 		 267 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.38 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  48.45 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.81 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.64 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.38 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.36 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  48 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  45.8 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  47.1 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.01 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.01 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  48 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.08 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  47.29 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.42 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  48 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  44.75 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.38 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.38 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.14 
 
 		 268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.27 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1946  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.74 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0029387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.97 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  44.96 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.42 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.75 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.1 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.63 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  46.24 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  46.24 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.75 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.36 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  45.32 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1616  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.08 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.193682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  46.48 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  45.11 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.36 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.05 
 
 		 263 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.05 
 
 		 263 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>