More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1046 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.11 
 
 
277 aa  349  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.32 
 
 
275 aa  345  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.7 
 
 
270 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.81 
 
 
274 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.84 
 
 
277 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.11 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.48 
 
 
277 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.81 
 
 
274 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60 
 
 
274 aa  341  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.65 
 
 
274 aa  332  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.36 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  61.19 
 
 
274 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.39 
 
 
293 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.01 
 
 
293 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.19 
 
 
278 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.42 
 
 
293 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.77 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.37 
 
 
273 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.74 
 
 
276 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.48 
 
 
276 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.48 
 
 
276 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.48 
 
 
276 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.84 
 
 
278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.48 
 
 
276 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.77 
 
 
293 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.06 
 
 
277 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53 
 
 
276 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  53 
 
 
276 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.48 
 
 
276 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.51 
 
 
303 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.63 
 
 
276 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.63 
 
 
276 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.74 
 
 
278 aa  291  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.28 
 
 
277 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.42 
 
 
276 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.76 
 
 
276 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.63 
 
 
277 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.41 
 
 
276 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.66 
 
 
281 aa  285  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  52.84 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.43 
 
 
277 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.71 
 
 
277 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.12 
 
 
276 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.06 
 
 
276 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  54.87 
 
 
273 aa  277  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  52.35 
 
 
269 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.58 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  52.03 
 
 
266 aa  265  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  51.81 
 
 
267 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.48 
 
 
283 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.12 
 
 
280 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.41 
 
 
267 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.37 
 
 
280 aa  233  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  45.9 
 
 
268 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  42.91 
 
 
266 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.99 
 
 
268 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
268 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.33 
 
 
268 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.64 
 
 
268 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.64 
 
 
268 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
267 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  41.55 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.61 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  44.36 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  41.45 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  41.7 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.82 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  41.37 
 
 
283 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1890  Undecaprenyl-diphosphatase  42.31 
 
 
278 aa  192  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  42.75 
 
 
267 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1946  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 
265 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0029387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.4 
 
 
265 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  41.73 
 
 
306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
268 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  42.49 
 
 
270 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  40.27 
 
 
302 aa  188  7e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  41.64 
 
 
267 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
268 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
268 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
268 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.34 
 
 
268 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  37.37 
 
 
255 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 
268 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.33 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.74 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.33 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.33 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>