More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0215 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  100 
 
 
267 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  92.13 
 
 
267 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  82.77 
 
 
267 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  74.56 
 
 
283 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  73.85 
 
 
283 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  74.47 
 
 
283 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.45 
 
 
268 aa  314  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.96 
 
 
268 aa  310  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.96 
 
 
268 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.33 
 
 
268 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  58.96 
 
 
305 aa  304  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.37 
 
 
268 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3536  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.69 
 
 
268 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.41 
 
 
268 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.92 
 
 
268 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.51 
 
 
268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.51 
 
 
268 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.16 
 
 
267 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.08 
 
 
268 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.04 
 
 
268 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.43 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.88 
 
 
268 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.81 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.81 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  50.2 
 
 
268 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  50.77 
 
 
269 aa  241  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.69 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  46.67 
 
 
274 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  46.54 
 
 
276 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 
267 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.33 
 
 
276 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.56 
 
 
276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.8 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.27 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.15 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.83 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  48 
 
 
273 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.51 
 
 
277 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.03 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
276 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
274 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.08 
 
 
274 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.58 
 
 
276 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.32 
 
 
274 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  44.65 
 
 
276 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 
277 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.95 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.22 
 
 
266 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.33 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  44.22 
 
 
266 aa  211  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  46.85 
 
 
286 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.24 
 
 
293 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  46.88 
 
 
270 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  47.01 
 
 
306 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  42.63 
 
 
267 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
293 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
293 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
274 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.41 
 
 
274 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.92 
 
 
273 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
274 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.89 
 
 
293 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.87 
 
 
277 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
276 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.53 
 
 
276 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
276 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
276 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.02 
 
 
278 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.87 
 
 
277 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.72 
 
 
278 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.06 
 
 
276 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.18 
 
 
276 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.16 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.96 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.18 
 
 
276 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  43.61 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  41.22 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  43.61 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.11 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.66 
 
 
281 aa  195  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.4 
 
 
270 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
303 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0262  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 
265 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
265 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.96 
 
 
272 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>