More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1120 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  100 
 
 		 268 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.58 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  50.2 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.19 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.38 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.58 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.58 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  50 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  50.2 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.59 
 
 		 274 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  47.49 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  47.76 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  47.76 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  47.01 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.59 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  50.19 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  49.6 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.88 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.26 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.26 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.26 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.08 
 
 		 278 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.46 
 
 		 293 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.68 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  48.45 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.74 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.74 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.91 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.53 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.4 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.89 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.88 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.06 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.55 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.67 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  47.47 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.1 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.65 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3536  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.58 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.66 
 
 		 277 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.31 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.08 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.28 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.66 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.62 
 
 		 268 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.18 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.62 
 
 		 268 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.88 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.95 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.95 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  46.01 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.05 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.75 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.53 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.11 
 
 		 268 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.49 
 
 		 277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.27 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.49 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.97 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  45.28 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  48.44 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.24 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.88 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.4 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.33 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.09 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  45.9 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  46.07 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0283  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  46.36 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.24 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.1 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0313  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.09 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.7 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  45.49 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.3 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.64 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.25 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  45.86 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0262  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.77 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1291  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.49 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.03 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>