More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3184 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
270 aa  528  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.34 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.56 
 
 
266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.24 
 
 
268 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.49 
 
 
268 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.49 
 
 
268 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.7 
 
 
268 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.97 
 
 
268 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.03 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 
268 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.19 
 
 
268 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  46.15 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
276 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.69 
 
 
268 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  46.88 
 
 
267 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  47.49 
 
 
267 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  47.71 
 
 
274 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.76 
 
 
280 aa  208  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.02 
 
 
280 aa  208  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  45.86 
 
 
268 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  45 
 
 
266 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  44.19 
 
 
266 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.11 
 
 
269 aa  205  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  44.66 
 
 
269 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.21 
 
 
293 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.24 
 
 
274 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  44.13 
 
 
283 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.03 
 
 
267 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.94 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  45.08 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.9 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.61 
 
 
283 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  42.76 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  42.76 
 
 
283 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  43.66 
 
 
269 aa  198  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.53 
 
 
277 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.74 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.95 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.21 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  45.56 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.04 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.63 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  43.43 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 
276 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1418  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.04 
 
 
265 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.47 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.47 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.7 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.47 
 
 
276 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
275 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
267 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  44.98 
 
 
254 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  41.95 
 
 
305 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.07 
 
 
268 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.07 
 
 
268 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  41.11 
 
 
276 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  45.69 
 
 
252 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.48 
 
 
277 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.59 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.13 
 
 
270 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.59 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.59 
 
 
276 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.83 
 
 
268 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 
274 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.22 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.7 
 
 
276 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  44.57 
 
 
258 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3536  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 
268 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  44.62 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 
293 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  42.49 
 
 
285 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1291  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.21 
 
 
264 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  44.23 
 
 
265 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 
274 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 
272 aa  188  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 
272 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 
272 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  41.67 
 
 
258 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
278 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.82 
 
 
274 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.86 
 
 
277 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.66 
 
 
274 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.43 
 
 
293 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.28 
 
 
293 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  42.7 
 
 
252 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  41.13 
 
 
267 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  41.13 
 
 
267 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.85 
 
 
277 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.86 
 
 
277 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  41.51 
 
 
267 aa  185  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  40.23 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.22 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.31 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.56 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  40.82 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.54 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.19 
 
 
263 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>