More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2137 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
266 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.07 
 
 
266 aa  314  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  55.56 
 
 
270 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.12 
 
 
268 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.66 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  48.84 
 
 
305 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.29 
 
 
277 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.06 
 
 
268 aa  231  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  48.64 
 
 
268 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.37 
 
 
274 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.83 
 
 
277 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.29 
 
 
267 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  48.02 
 
 
276 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  44.87 
 
 
266 aa  229  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.86 
 
 
268 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.24 
 
 
268 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.06 
 
 
268 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.99 
 
 
276 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.19 
 
 
276 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
276 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.77 
 
 
277 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.19 
 
 
265 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
277 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.48 
 
 
268 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.39 
 
 
276 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  44.49 
 
 
266 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  46.92 
 
 
276 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.91 
 
 
268 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.77 
 
 
277 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46 
 
 
267 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.42 
 
 
265 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.17 
 
 
273 aa  222  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.03 
 
 
276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.79 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.79 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  45.82 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  48.59 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.55 
 
 
268 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.66 
 
 
268 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.18 
 
 
268 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.24 
 
 
293 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.98 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  46.06 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.28 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1418  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.56 
 
 
265 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
274 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.01 
 
 
273 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
274 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
275 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.15 
 
 
278 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
274 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
277 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
293 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  43.87 
 
 
269 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  44.4 
 
 
269 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  46.83 
 
 
267 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3536  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.33 
 
 
268 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
277 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
270 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  46.18 
 
 
267 aa  204  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.18 
 
 
274 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 
276 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.78 
 
 
278 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.62 
 
 
268 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.62 
 
 
268 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1291  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45 
 
 
264 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.94 
 
 
276 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.14 
 
 
280 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.94 
 
 
276 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.94 
 
 
276 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 
276 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.89 
 
 
293 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.3 
 
 
272 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.3 
 
 
272 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.3 
 
 
272 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.89 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.89 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.57 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.14 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  45.53 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  45.16 
 
 
258 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.02 
 
 
283 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1616  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.78 
 
 
263 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.193682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>