More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0378 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
265 aa  520  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.99 
 
 
265 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1418  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  72.45 
 
 
265 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1291  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  71.04 
 
 
264 aa  344  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1946  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  66.67 
 
 
265 aa  332  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0029387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1616  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  68.58 
 
 
263 aa  328  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.193682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.77 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.77 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.77 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.36 
 
 
274 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.43 
 
 
273 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.74 
 
 
273 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
270 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.94 
 
 
273 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.45 
 
 
272 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.74 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.74 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.74 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.74 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0313  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.45 
 
 
265 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.45 
 
 
265 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.45 
 
 
265 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0283  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.45 
 
 
265 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0795  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.69 
 
 
273 aa  235  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.38 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.35 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.62 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1110  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
263 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.97 
 
 
263 aa  232  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.97 
 
 
263 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.35 
 
 
265 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.97 
 
 
265 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1296  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
263 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00356905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
263 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
263 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
263 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1403  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.59 
 
 
263 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.21 
 
 
263 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0262  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.05 
 
 
265 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1436  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.01 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.648301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3908  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.01 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.82 
 
 
274 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.81 
 
 
274 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.81 
 
 
274 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.83 
 
 
276 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.19 
 
 
266 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.8 
 
 
275 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  45.77 
 
 
266 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  46.59 
 
 
269 aa  208  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.63 
 
 
277 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.02 
 
 
277 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.49 
 
 
277 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.79 
 
 
273 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49 
 
 
274 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  46.03 
 
 
268 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.97 
 
 
269 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.4 
 
 
274 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
293 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  48.61 
 
 
276 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.74 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.64 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.64 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
274 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  42.75 
 
 
266 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1073  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.62 
 
 
273 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.24 
 
 
293 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.92 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.14 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  45.04 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.88 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.92 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  46.43 
 
 
273 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 
276 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.06 
 
 
277 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 
276 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 
276 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 
276 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.14 
 
 
266 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.95 
 
 
278 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.15 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.17 
 
 
278 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  45.28 
 
 
276 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  45 
 
 
269 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.41 
 
 
268 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.88 
 
 
276 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.09 
 
 
276 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  47.08 
 
 
274 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.8 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.1 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>