More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4274 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  50.19 
 
 
276 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.19 
 
 
276 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.02 
 
 
273 aa  275  8e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  50.75 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.52 
 
 
277 aa  271  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.62 
 
 
274 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.19 
 
 
276 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.81 
 
 
276 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  50.75 
 
 
273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.52 
 
 
278 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.81 
 
 
276 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.44 
 
 
276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.44 
 
 
276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.44 
 
 
276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.16 
 
 
277 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.47 
 
 
293 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.43 
 
 
276 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.39 
 
 
277 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.43 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.06 
 
 
277 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.75 
 
 
293 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.3 
 
 
274 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.24 
 
 
293 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.18 
 
 
293 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.68 
 
 
276 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.3 
 
 
277 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  48.48 
 
 
276 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.04 
 
 
293 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.07 
 
 
276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  50.37 
 
 
269 aa  258  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.25 
 
 
278 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.7 
 
 
276 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.96 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.15 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.96 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.33 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  48.67 
 
 
266 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 
270 aa  250  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.37 
 
 
281 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.19 
 
 
303 aa  248  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.32 
 
 
277 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.44 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.07 
 
 
277 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.66 
 
 
274 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  47.41 
 
 
285 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.77 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.53 
 
 
274 aa  238  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.17 
 
 
274 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.04 
 
 
274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  46.51 
 
 
267 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  47.55 
 
 
268 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  46.54 
 
 
267 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  44.8 
 
 
283 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  46.24 
 
 
283 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  44.91 
 
 
283 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  45.77 
 
 
267 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.47 
 
 
268 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.47 
 
 
268 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.06 
 
 
268 aa  221  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.77 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.95 
 
 
268 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  45.66 
 
 
267 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  45.21 
 
 
305 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.35 
 
 
269 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46 
 
 
266 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.83 
 
 
268 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.83 
 
 
268 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.92 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.7 
 
 
267 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  43.8 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.31 
 
 
268 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
280 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.31 
 
 
268 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
280 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.67 
 
 
274 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.58 
 
 
268 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  44.53 
 
 
254 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.48 
 
 
272 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
272 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.67 
 
 
304 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.01 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.31 
 
 
268 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
273 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
273 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46 
 
 
266 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
273 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.65 
 
 
270 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.15 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  42.37 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.37 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.37 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>