More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0788 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  100 
 
 
281 aa  557  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  66.19 
 
 
258 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  52.11 
 
 
266 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  49.83 
 
 
280 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  50.94 
 
 
263 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  52.99 
 
 
265 aa  244  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3546  undecaprenol kinase  50 
 
 
264 aa  242  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  43.82 
 
 
269 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  41.91 
 
 
266 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  40.65 
 
 
274 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 
276 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
277 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  40.29 
 
 
276 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
276 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.65 
 
 
278 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
277 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  41.01 
 
 
270 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.19 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.64 
 
 
267 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  38.89 
 
 
266 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  40.96 
 
 
268 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.26 
 
 
276 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.98 
 
 
266 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  39.16 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  38.83 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.42 
 
 
277 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.21 
 
 
277 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.14 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.42 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  39.71 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.35 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
274 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  40.59 
 
 
273 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.86 
 
 
269 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.41 
 
 
268 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.91 
 
 
268 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
268 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  38.11 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  37.73 
 
 
255 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  37.22 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
277 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
267 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  40.43 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.41 
 
 
278 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.18 
 
 
268 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.18 
 
 
268 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.79 
 
 
277 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  36.46 
 
 
276 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  35.54 
 
 
293 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.31 
 
 
266 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  39.78 
 
 
256 aa  176  5e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.93 
 
 
304 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.08 
 
 
284 aa  176  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  34.09 
 
 
302 aa  175  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
270 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
273 aa  176  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  39.5 
 
 
283 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.29 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  39.35 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  35.42 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.04 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  39.5 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.91 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  39.85 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 
284 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  38.89 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.59 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.24 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  38.18 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  37.45 
 
 
306 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  37.37 
 
 
267 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  37.37 
 
 
267 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1150  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.77 
 
 
268 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  37.55 
 
 
286 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2811  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.77 
 
 
268 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.08 
 
 
268 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.68 
 
 
274 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.02 
 
 
268 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.18 
 
 
278 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  37.77 
 
 
267 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.13 
 
 
274 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
274 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.46 
 
 
274 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  35.16 
 
 
254 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2344  undecaprenol kinase  39.15 
 
 
283 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373318  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.3 
 
 
273 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1418  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.11 
 
 
265 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.74 
 
 
268 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 
268 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  37.41 
 
 
258 aa  168  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  34.78 
 
 
255 aa  168  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  34.8 
 
 
254 aa  168  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
280 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 
274 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1616  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.26 
 
 
263 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.193682  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  33.7 
 
 
255 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.14 
 
 
268 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.73 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>