More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1538 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  54.29 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  54.72 
 
 
263 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  54.72 
 
 
265 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  49.82 
 
 
281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  45.71 
 
 
269 aa  238  8e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3546  undecaprenol kinase  51.4 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  48.95 
 
 
266 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  40.75 
 
 
268 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.43 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1147  Bacitracin resistance protein BacA  42.91 
 
 
281 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000333302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.43 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.73 
 
 
284 aa  182  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.43 
 
 
284 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  39.86 
 
 
293 aa  182  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.63 
 
 
278 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  41.39 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.45 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  40.74 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0138  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.57 
 
 
279 aa  178  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  40.93 
 
 
258 aa  178  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
280 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
268 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  38.43 
 
 
267 aa  175  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.91 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  38.08 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  38.08 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.18 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.38 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  38.23 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  42.01 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  42.22 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  38.46 
 
 
266 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
273 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  42.18 
 
 
273 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  42.18 
 
 
273 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.83 
 
 
269 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
273 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
273 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
273 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  36.73 
 
 
255 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.44 
 
 
277 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0133  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.05 
 
 
293 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
270 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
273 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.18 
 
 
273 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  40.88 
 
 
268 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.77 
 
 
268 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.32 
 
 
273 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  38.08 
 
 
270 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
268 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.71 
 
 
268 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  40.81 
 
 
276 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  38.55 
 
 
255 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  39.86 
 
 
258 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  40.43 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  41.18 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  38.35 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.45 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.18 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.71 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  36.3 
 
 
314 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0173909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.19 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  40.22 
 
 
269 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.56 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0945  Undecaprenyl-diphosphatase  37.09 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130471  hitchhiker  0.000579984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.32 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  38.41 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.33 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
276 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
277 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  39.01 
 
 
274 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.36 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.94 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.6 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
265 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
265 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0283  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
265 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.46 
 
 
273 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.94 
 
 
272 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.48 
 
 
276 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  37.8 
 
 
283 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  38.18 
 
 
268 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  37.8 
 
 
283 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2137  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.21 
 
 
266 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0313  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
265 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
290 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.999364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  38.38 
 
 
266 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.77 
 
 
263 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  37.04 
 
 
254 aa  158  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>