More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2305 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.73 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.99 
 
 
278 aa  348  5e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0945  Undecaprenyl-diphosphatase  50.99 
 
 
311 aa  298  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130471  hitchhiker  0.000579984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10180  Undecaprenyl-diphosphatase  49.15 
 
 
302 aa  296  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.0119767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  48.37 
 
 
314 aa  295  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0173909 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0138  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52 
 
 
279 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.69 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.22 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0381  Undecaprenyl-diphosphatase  46.86 
 
 
310 aa  271  9e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.100133  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.81 
 
 
278 aa  262  6e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0133  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.36 
 
 
293 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.43082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  48.88 
 
 
266 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  47.67 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  45.39 
 
 
293 aa  236  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4087  undecaprenol kinase  47.06 
 
 
270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0278753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
304 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.21 
 
 
304 aa  201  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
280 aa  201  8e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.43 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.57 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1147  Bacitracin resistance protein BacA  41.73 
 
 
281 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000333302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  43.45 
 
 
266 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  38.49 
 
 
269 aa  188  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.59 
 
 
269 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  42.21 
 
 
267 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  42.21 
 
 
267 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.06 
 
 
293 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  40.67 
 
 
274 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  42.25 
 
 
267 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
267 aa  184  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  41.43 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.35 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  41.25 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  41.54 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  41.76 
 
 
258 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0569  putative undecaprenol kinase  41.06 
 
 
265 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  41.29 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  40.96 
 
 
256 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  40 
 
 
273 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  41.29 
 
 
258 aa  179  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.21 
 
 
293 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  38.49 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.35 
 
 
293 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
277 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
293 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
278 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.84 
 
 
274 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.23 
 
 
276 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 
273 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
273 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.73 
 
 
270 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
277 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
276 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  39.71 
 
 
258 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  37.69 
 
 
255 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
273 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  38.72 
 
 
266 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
273 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
273 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
273 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
273 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.49 
 
 
273 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  42.05 
 
 
252 aa  175  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
272 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
276 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
277 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.23 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.23 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  39.18 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.55 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  38.85 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  39.39 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.73 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
276 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
277 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  38.43 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 
276 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0795  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
273 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.63 
 
 
303 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
268 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.45 
 
 
274 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.98 
 
 
274 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>