More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1204 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1204  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0750612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1390  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  98.36 
 
 
304 aa  593  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1147  Bacitracin resistance protein BacA  46.74 
 
 
281 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000333302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.61 
 
 
269 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.37 
 
 
273 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  44.01 
 
 
273 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.66 
 
 
273 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  44.01 
 
 
273 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.66 
 
 
273 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.66 
 
 
273 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.66 
 
 
273 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.01 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.29 
 
 
270 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.86 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.96 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1436  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.648301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3908  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1110  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
263 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1502  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1542  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0270551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  40.41 
 
 
269 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1296  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00356905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1268  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1270  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.033406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
278 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1403  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
263 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.16 
 
 
272 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.16 
 
 
272 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.16 
 
 
272 aa  206  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
272 aa  205  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.65 
 
 
263 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.74 
 
 
278 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.67 
 
 
267 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1407  undecaprenol kinase  42.5 
 
 
268 aa  202  8e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.41 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.41 
 
 
272 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  40.47 
 
 
293 aa  198  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1418  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0313  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.83 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0795  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.55 
 
 
273 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
273 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.36 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0283  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.36 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0251  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
265 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.09 
 
 
275 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.8 
 
 
265 aa  191  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0312  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.14 
 
 
265 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.14 
 
 
265 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1073  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.78 
 
 
273 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.34 
 
 
276 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.89 
 
 
284 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000583007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0262  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.54 
 
 
265 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  41.52 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.07 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.99 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
277 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2758  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
273 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000523716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.8 
 
 
283 aa  188  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.41 
 
 
278 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.85 
 
 
293 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.43 
 
 
277 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  38.68 
 
 
266 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1291  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.55 
 
 
264 aa  186  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.33 
 
 
274 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 
265 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  38.41 
 
 
274 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.12 
 
 
290 aa  185  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.28 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.66 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.54 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.16 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.99 
 
 
293 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  41.05 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.91 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0215  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.41 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.88 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.05 
 
 
280 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.89 
 
 
273 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.54 
 
 
293 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  42.07 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.64 
 
 
274 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  36.09 
 
 
274 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1616  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.52 
 
 
263 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.193682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  38.23 
 
 
276 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.86 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.23 
 
 
276 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.66 
 
 
276 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.89 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0378  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.115432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>