62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2455 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2455  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2617  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  44.68 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0893  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.31 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2559  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.3 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.212566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0069  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.91 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0735  PTS system fructose subfamily IIA subunit  32.74 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2604  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.208076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1064  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.32202e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3198  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.55 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22745  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3794  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.43 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0123401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3653  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.93 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.981965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3711  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.43 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.515832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3779  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.36 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0950  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.57 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.740321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0989  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.57 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0855  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.46 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.767445  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0957  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.38 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0460537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4265  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.3 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0563  PTS system, IIA component  24.15 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.11237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0868  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.13 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0716373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57960  nitrogen regulatory IIA protein  30.46 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5037  nitrogen regulatory IIA protein  32.03 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0404  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.63 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2620  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.12 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4557  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4455  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.57 
 
 		 154 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0751  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.56 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00822403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0225  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.38 
 
 		 156 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1001  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.35 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3793  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4149  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.21 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3926  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.63 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3274  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.63 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4612  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.38 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0300  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.57 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.684561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2228  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.93 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2228  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.96 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.193382  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2631  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.43 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3023  phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system, EIIA component  30.43 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2111  PTS system, nitrogen regulatory IIA component  28.57 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0288  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.22 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0014  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.31 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0353  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.21 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0261  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.68 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0078  PTS system, nitrogen regulatory IIA protein  30.67 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0406  putative nitrogen regulatory IIA (enzyme IIA-Ntr) (phosphotransferase enzyme II, A component) transcription regulator protein  28.68 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.275457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3180  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0484088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3999  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  37.36 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13280  PTS system D-fructose-specific IIA component (F1P-forming)/PTS system D-fructose-specific IIB component (F1P-forming)/PTS system D-fructose-specific IIC component (F1P-forming)  34.91 
 
 		 646 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.839336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1620  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.95 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2940  PTS system, nitrogen regulatory IIA protein  29.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0595  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0579  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1512  PTS system, nitrogen regulatory IIA protein  29.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0763  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3110  PTS system, nitrogen regulatory IIA protein  29.58 
 
 		 151 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2067  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.41 
 
 		 153 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0484  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  35.8 
 
 		 151 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  25.35 
 
 		 201 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1618  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.26 
 
 		 153 aa  41.6  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.999957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0570  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.57 
 
 		 147 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>