118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0664 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0664  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  36.02 
 
 
173 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  37.82 
 
 
157 aa  88.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  35.76 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  32.68 
 
 
158 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  45.87 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  35.19 
 
 
174 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  32.45 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  35.17 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  34.62 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  42.61 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  38.14 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  36.75 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  37.07 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  37.07 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  36.44 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  32.12 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  37.29 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  37.29 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  37.29 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  36.44 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  30 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  39.84 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  37.91 
 
 
193 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  36.21 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  30.52 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  30.52 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  35.04 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  38.33 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  37.07 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  36.19 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  36.21 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  31.79 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  33.59 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  35.1 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  34.42 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  38.79 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  29.49 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  32.58 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  34.44 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  35.11 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  29.61 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  25.17 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  31.01 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  31.58 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  33.54 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  33.54 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  34.23 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  32.35 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  28.4 
 
 
575 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  34.65 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  31.68 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  40.98 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  35 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  36.92 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  36.97 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  30.43 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  28.12 
 
 
171 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1550  hypothetical protein  29.11 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  38.84 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  31.78 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  34.15 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  36.36 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  39.34 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  39.42 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  39.34 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0592  protein of unknown function DUF985  30.08 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  39.83 
 
 
286 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  31.54 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  33.87 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  37.7 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  29.82 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03981  hypothetical protein  26.75 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  27.86 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  34.59 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  37.7 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  38.52 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  37.7 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  37.38 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  33.08 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  27.14 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  31.4 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  29.8 
 
 
176 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  32.06 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  28.46 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  30.57 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  30.91 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  28.87 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  35.82 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  32.82 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  34.85 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>